2003年3月公司决定在重庆北部新区人和镇高新园购地约50亩，并于当年4月正式启动“庆余堂”异地扩建一期工程。至2005年3月，公司GMP异地扩建工程通过竣工验收，一期工程占地约25亩，已建厂房约1万平方米，一期工程总投资约4000万元，二期工程预留了25亩作为以后发展之需。公司现有生产线10余条，口服固体制剂有头孢类（胶囊、片剂）、青霉素类（胶囊）、普通类（胶囊、片剂）；粉针剂有头孢类（粉针、冻干）、青霉素（粉针）、普通类（粉针、冻干）。其中，新建的口服青霉素车间、口服头孢车间和口服普通车间于2004年9月竣工，于2004年11月通过重庆食品药品监督管理局口服车间GMP认证现场检查，2005年1月获得GMP证书。新建的头孢粉针（冻干）车间，青霉素粉针车间，普通冻干粉针车间于2005年9月通过国家食品药品监督管理局进行的GMP认证现场检查，并于2005年11月获得GMP证书，并已形成年产粉针2000—3000万瓶，胶囊、片剂各约2.5亿粒（片）的生产能力。普通粉针车间于2006年11月份通过国家食品药品监督管理局进行的GMP认证。